Home
| VOLUME 115 (2022) | ISSUE 12 | PAGE 811 |
|---|
|
Влияние активного выпетливания на статистику тройных контактов в модели интерфазных хромосом1)
С. А. Белан+* 2), Д. Е. Старков+*
+Институт теоретической физики им. Л. Д. Ландау РАН, 142432 Черноголовка, Россия *Национальный исследовательский университет Высшая школа экономики, факультет физики, 101000 Москва, Россия
Abstract
Теоретически исследуется статистика тройных контактов между участками интефазной хромосомы в присутствии механизма активного выпетливания. Моделируя хроматин как идеальную полимерную цепь с вмороженным беспорядком случайных петель, мы находим в рамках однопетлевого приближения выражение для условной вероятности контакта между двумя участками цепи при наличии дополнительного контакта с третьим участком. Анализ полученного выражения показывает нарушение механизмом выпетливания масштабной инвариантности, марковости и гауссовости идеальной цепи, подсказывая пути извлечения характеристик процесса выпетливания из экспериментальных данных касательно частот кратных контактов в интерфазных хромосомах. Кроме того, результаты работы свидетельствуют об ограниченности широко распространенных гауссовых полимерных моделей в вопросе воспроизведения некоторых особенностей конформационной статистики хромосом. |