Влияние активного выпетливания на статистику тройных контактов в модели интерфазных хромосом1)
С. А. Белан+* 2), Д. Е. Старков+*
+Институт теоретической физики им. Л. Д. Ландау РАН, 142432 Черноголовка, Россия
*Национальный исследовательский университет Высшая школа экономики, факультет физики, 101000 Москва, Россия
Abstract
Теоретически исследуется статистика тройных контактов между
участками интефазной хромосомы в присутствии механизма активного
выпетливания.
Моделируя хроматин как идеальную полимерную цепь с вмороженным
беспорядком случайных петель, мы находим в рамках однопетлевого
приближения выражение для условной вероятности контакта между двумя
участками цепи при наличии дополнительного контакта с третьим участком.
Анализ полученного выражения показывает нарушение механизмом выпетливания
масштабной инвариантности, марковости и гауссовости идеальной цепи,
подсказывая пути извлечения характеристик процесса выпетливания из
экспериментальных данных касательно частот кратных контактов в
интерфазных хромосомах.
Кроме того, результаты работы свидетельствуют об ограниченности широко
распространенных гауссовых полимерных моделей в вопросе воспроизведения
некоторых особенностей конформационной статистики хромосом.