Home
| VOLUME 117 (2023) | ISSUE 10 | PAGE 783 |
|---|
|
Теория функционала плотности, молекулярная динамика и AlteQ для исследования баймантуолуоамида A и баймантуолуоамида B и выявления потенциальных ингибиторов белков Mpro - новой мишени для лечения SARS COVID-191)
К. Гурушанкарa,b 2), 3), С. К. Джеясиланc,d 3), М. Гришинаa, И. Сисвантоe 3), Р. Тиварf 3), Н. Н. Т. Пуспанингсихg 3)
aЛаборатория компьютерного моделирования лекарственных средств Высшей медико-биологической школы Южно-Уральского государственного университета, 454080 Челябинск, Россия bDepartment of Physics, Kalasalingam Academy of Research and Education, Krishnankoil, 626126 Tamilnadu, India cPost Graduate & Research Department of Physics, N.M.S.S.V.N. College, Madurai, 625019 Tamilnadu, India dPost Graduate Department of Physics, Mannar Thirumalai Naciker College, Madurai, 625004 Tamilnadu, India eBioinformatic Laboratory, UCoE Research Center for Bio-Molecule Engineering Universitas Airlangga, 60115 Surabaya, Indonesia fDepartment of Physics, Coordinator Research and Development Cell, Dr CV Raman University, Kargi Kota, 495113 Bilaspur CG, India gDepartment of Chemistry, Faculty of Science and Technology, Universitas Airlangga, 60115 Surabaya, Indonesia
Abstract
COVID-19 привел к эпидемическим условиям во всем мире. Несмотря на усилия ученых всего мира по разработке эффективных лекарств против этого вируса, в настоящее время не существует признанного лекарства от COVID-19. Успешные методы лечения различных заболеваний основаны на использовании натуральных компонентов, содержащихся в лекарственных растениях, что также имеет решающее значение для разработки новых лекарств. Это исследование направлено на то, чтобы понять роль молекул баймантуолуоамида А (baia) и баймантуолуоамида В (baib) в лечении COVID-19. Первоначально теория функционала плотности (DFT) с базисным набором Becke3-Lee-Yang-Parr (B3LYP) 6-311 + G(d,p) использовалась для изучения их электронных потенциалов. Ряд характеристик, в том числе разность между энергиями низшей свободной (НСМО) и высшей занятой (ВЗМО) молекулярными орбиталями, жесткость и мягкость, электроотрицательность и электрофильность также были рассчитаны для обсуждения реакционной способности молекул. С использованием метода NBO (Natural Bond Orbital) исследована биологически активная природа и стабильность указанных соединений. Кроме того, оба соединения являются потенциальными ингибиторами основной протеазы (Mpro). Проведено моделирование молекулярной динамикой и методом AlteQ. |